甲狀腺結核臨床表現(xiàn)缺乏特異性，加之既往無結核病史，故在未獲得病理診斷前，不容易確診。臨床上需要與之鑒別的甲狀腺疾病有：亞急性甲狀腺炎 本病好發(fā)于女性，是病毒感染后引起甲狀腺濾泡破裂，膠質溢出造成，病程較長。核素掃描可顯示冷結節(jié)，難與甲狀腺結核鑒別。用甲狀腺素或左甲狀腺素治療后癥狀可緩解，且有自愈的傾向;慢性甲狀腺炎 主要是淋巴性甲狀腺炎和侵襲性纖維性甲狀腺炎，特別是后者可表現(xiàn)硬實的甲狀腺結節(jié)，不易與增生型甲狀腺結核鑒別;甲狀腺腺瘤或甲狀腺癌 甲狀腺癌轉移到頸淋巴結而誤診為淋巴結核并不少見。相反，亦有頸淋巴結核與甲狀腺癌同時發(fā)生，也有些甲狀腺結核合并頸淋巴結核，而被誤診為癌腫，Rankin分析21例誤診的甲狀腺結核時發(fā)現(xiàn)，12例誤診為毒性彌漫性甲狀腺，4例誤診為甲狀腺腺瘤，4例誤診為慢性甲狀腺炎，1例誤診為甲狀腺囊腫并出血。高方報道的6例甲狀腺結核均在手術前皆被誤診，其中誤診為甲狀腺瘤4例，甲狀腺癌1例，急性化膿性甲狀腺炎1例。